Yükseköğretim Kurulu ile Sağlık Bakanlığı arasında imzalanan protokol gereği 1997 yılında Atatürk Üniversitesi bünyesinde Ağrı Sağlık Yüksekokulu olarak açılmış olan okulumuz, 2003-2004 Eğitim - Öğretim yılında Hemşirelik Bölümüne öğrenci alarak lisans düzeyinde eğitim vermeye başlamıştır.  2016 - 2017 Eğitim - Öğretim yılında Beslenme ve Diyetetik Bölümüne, 2021 - 2022 Eğitim - Öğretim yılında Ebelik Bölümüne öğrenci alınarak fakültemizdeki aktif program sayısı üçe çıkarılmıştır. Fakültemiz 20.11.2021 tarih ve 31665 sayılı Resmi Gazetede yayımlanan 19.11.2021 tarih ve 4821 sayılı Cumhurbaşkanı kararına istinaden Sağlık Yüksekokulunun kapatılmasıyla 20.11.2021 tarihinde kurulmuş olup, eğitim dili Türkçedir. Fakültemiz, 31 akademik (2 Profesör, 4 Doçent, 11 Doktor Öğretim Üyesi, 5 Öğretim Görevlisi, 9 Araştırma Görevlisi), 5 idari personel ve 1102 öğrenciyle eğitim-öğretimini sürdürmektedir.